Dall’inizio della pandemia, i test diagnostici hanno svolto un ruolo fondamentale nel controllo della diffusione della SARS-CoV-2, il virus che causaCOVID 19.Test antigenici rapidieseguiti a casa o in ambiente clinico forniscono risultati in 15 minuti o meno.Prima viene diagnosticata una persona, prima può rivolgersi al medico e isolarsi dagli altri.Ma quando compaiono nuove varianti del virus, tali varianti potrebbero non essere rilevate da questi test.
La maggior parte dei test antigenici rapidi sono progettati per rilevare la proteina nucleocapside SARS-CoV-2 o la proteina N.Questa proteina si trova in abbondanza nelle particelle virali e nelle persone infette.Kit per test rapidiDi solito contengono due diversi anticorpi diagnostici che si legano a parti diverse della proteina N.Quando un anticorpo si lega alla proteina N contenuta in un campione, sul kit del test appare una linea colorata o un altro segnale, che indica un'infezione.
La proteina N è costituita da 419 unità strutturali di aminoacidi.Ognuno di essi può essere sostituito da un altro amminoacido mediante mutazione.Gruppo di ricerca guidato dal Ph.D.Philip Frank ed Eric Ortlund della Emory University hanno deciso di indagare su come questo singolo cambiamento di aminoacidi influisce sulle prestazioni di un test antigenico rapido.Hanno utilizzato una tecnica chiamata scansione profonda delle mutazioni per valutare simultaneamente come ciascuna mutazione nella proteina N del virus influisce sul legame con un anticorpo diagnostico.I loro risultati sono stati pubblicati su Cell il 15 settembre 2022.
I ricercatori hanno creato una libreria completa di quasi 8.000 mutazioni proteiche N.Queste varianti rappresentano oltre il 99,5% di tutte le possibili mutazioni.Hanno poi valutato come ciascuna variante interagiva con 17 diversi anticorpi diagnostici utilizzati in 11 test antigenici rapidi disponibili in commercio, compresi i comunikit per la casa.
Il team ha valutato quali mutazioni della proteina N influenzano il riconoscimento degli anticorpi.Sulla base di queste informazioni, hanno creato un “profilo di mutazione di fuga” per ciascun anticorpo diagnostico.Questo profilo identifica mutazioni specifiche nella proteina N che possono influenzare la capacità dell'anticorpo di legarsi al suo bersaglio.L’analisi ha dimostrato che gli anticorpi utilizzati negli odierni test rapidi riconoscono e legano tutte le varianti passate e presenti di SARS-CoV-2 di interesse e preoccupazione.
Sebbene diversi anticorpi diagnostici riconoscano la stessa regione della proteina N, i ricercatori hanno scoperto che ciascun anticorpo ha una firma unica di mutazioni di fuga.Poiché il virus SARS-CoV-2 continua a mutare e a generare nuove varianti, questi dati possono essere utilizzati per segnalare gli anticorpi del kit di test che potrebbero dover essere rivalutati.
“L’identificazione accurata ed efficiente degli individui infetti rimane una strategia fondamentale per la mitigazione del COVID-19 e il nostro studio fornisce informazioni sulle future mutazioni del SARS-CoV-2 che potrebbero interferire con il rilevamento”, ha affermato Ortlund.“I risultati qui delineati ci consentono di adattarci rapidamente a questo virus man mano che nuove varianti continuano ad emergere, presentando implicazioni cliniche e di salute pubblica immediate”.
Background: Mutation Deep Scan rileva le mutazioni di fuga nel nucleocapside SARS-CoV-2 utilizzando i test antigenici rapidi attualmente disponibili.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022 settembre 15;185(19):3603-3616.e13.Ministero dell'Interno: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 agosto 2022 PMID: 36084631.
Finanziamento: Istituto nazionale per l’imaging biomedico e la bioingegneria NIH (NIBIB), Istituto nazionale per il diabete, le malattie digestive e renali (NIDDK) e Istituto nazionale per le allergie e le malattie infettive (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters è un aggiornamento settimanale dei principali risultati della ricerca NIH esaminati dagli esperti NIH.È pubblicato dall'Ufficio Comunicazione e Affari Pubblici del Direttore dell'Istituto Superiore di Sanità.